Digitalizace v Národní lékařské knihovně
Úvod
Získávání, zpracování, trvalé uchování a zpřístupnění fondů a sbírek tradičních dokumentů je v prostředí knihoven relativně dobře a kvalitně zajištěno. Knihovny se však musí vypořádat s hrozbou ztráty tištěných dokumentů způsobenou degradací kyselého papíru, který se používal téměř 150 let a poškozením dokumentů častým používáním. Efektivním prostředkem pro uchování ohrožených publikací je jejich digitalizace a následné zpřístupnění v digitálních knihovnách, archivech nebo repositářích.
V souvislosti s rozvojem informačních a komunikačních technologií knihovny řeší získávání, zpracování, uložení a zpřístupnění nových typů dokumentů, které vznikly již elektronicky. Zejména se jedná o problémy dlouhodobého uchování a zpřístupnění těchto digitálních dokumentů.
Potřeba a nutnost dlouhodobě uchovávat a zpřístupňovat kulturní dědictví a vědecké informace v tradičních i elektronických dokumentech je formulována v iniciativě Komise evropských společenství i2010: Digital Libraries Initiative. Pro knihovny v České republice je určena Koncepce trvalého uchování knihovních sbírek tradičních a elektronických dokumentů v knihovnách ČR do roku 2010, která předpokládá vytváření oborových digitálních knihoven a archivů s návazností na systém Národní digitální knihovny.
Situace v NLK
Národní lékařská knihovna (NLK) se již v roce 2004 zapojila do
programu MK ČR VISK 6 "Národní program digitálního zpřístupnění
vzácných dokumentů Memoriae Mundi Series Bohemica" a v roce 2008 do
programu MK ČR VISK 7 "Národní program mikrofilmování a digitálního
zpřístupňování dokumentů ohrožených degradací kyselého papíru –
Kramerius".
Následným logickým krokem je zpřístupnění výstupů uvedených programů
uživatelům NLK. Knihovníci a informační pracovníci NLK
rozvíjejí aktivity v získávání dokumentů a jejich
digitalizace dokumentů z fondu NLK. Budování a údržba digitálního
archivu (DA) je perspektivním úkolem NLK a vyžaduje investiční finanční
prostředky.
NLK zahájila spolupráci s českými nakladateli odborných biomedicínských
periodik, která se soustřeďuje na možnosti získávání a zpřístupnění
elektronických dokumentů v digitálním archivu. Neméně důležité je
získávat obsah archivu přímo od autorů vědeckých informací a motivovat
je k využívání DA pro archivaci a zpřístupňování jejich prací.
Digitální archiv NLK
Pro implementaci DA byl vybrán český systém Kramerius. Kramerius je software s otevřeným zdrojovým kódem produkovaný firmou Qbizm Technologies, na jehož vývoji se podílí Národní knihovna ČR (NK ČR), Knihovna Akademie věd ČR a Moravská zemská knihovna v Brně. Vývoj systému je zajišťován finančními dotacemi Ministerstva kultury ČR a Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy ČR. Systém Kramerius slouží ke zpřístupňování digitálních dokumentů v souladu s autorským zákonem. V současnosti podporuje periodika a monografie, do budoucna se plánuje rozšíření i pro ostatní typy dokumentů. Systém umožňuje replikaci dat mezi jednotlivými instalacemi.
Provoz DA zahrnuje tyto činnosti:
- Akvizice - výběr a získání dokumentů pro DA
- Zpracování
- Ochrana
- Zpřístupnění
Akvizice
Digitalizace tištěných periodik a monografií se odvíjí zejména od možností finančního rozpočtu NLK, neboť v programech VISK je vždy vyžadována spoluúčast přijemce. U vlastní digitalizace jsme omezeni kapacitou zpracovatelské linky a počtem digitalizačních pracovišť - zatím pouze 1. Digitalizují se primárně poničené exempláře vytištěné na kyselém papíru a často využívané příručkové publikace, které nemá NLK ve více výtiscích. Před zahájením digitalizace se vždy ověřuje, zdali daný dokument nedigitalizovala již jiná instituce v ČR. Pro tento účel je možné využít Registr digitalizace. U dokumentů, které vznikly již elektronickou cestou je klíčové zahájit spolupráci s nakladateli a autory. Toto se ukazuje jako problém - řada nakladatelů a autorů má neopodstatněnou obavu z podepsání smlouvy, která je podmínkou pro trvalou archivaci a zpřístupnění dokumentů v DA. Dalším zdrojem může být replikace digitalizovaných dokumentů, které má NLK ve fondu, z archivů jiných knihoven ČR na základě vzájemné dohody, zejména s Národní knihovnou ČR.
Zpracování
Pro všechny zdigitalizované dokumenty je vytvořen (pokud již neexistuje) bibliografický záznam v systému Medvik. Digitalizovaný dokument v DA a bibliografický záznam jsou vzájemně propojené přes URL odkazy, takže se uživatel dostane z bibliografického záznamu přímo do digitální verze a naopak. V případech velmi zničených exemplářů, mají uživatelé k dispozici už pouze digitální kopii.
U dokumentů, u nichž se provádí analytické zpracování (periodika, sborníky, grantové zprávy) se propojují jednotlivé složky (články) digitálního dokumentu s databází Bibliographia medica Čechoslovaca (BMČ).
Vlastní digitalizace
Dokument určený k digitalizaci je komplet naskenován v rozlišení 300 DPI (Plustek OpticBook 4600) a je automaticky provedeno OCR, výstupem je soubor ve formátu PDF s textovou vrstvou. Po kontrole kvality se následně digitální kopie rozdělí na jednotlivé soubory - části podle typu dokumentu a připojí se k bibliografickému záznamu v systému Medvik. Po doplnění a kompletaci technických a administrativních metadat je vyexportován XML soubor dle DTD Kramerius, který je následně importován do DA.
Zpracování dat z VISK a Manuscriptoria
Externě digitalizované dokumenty (program VISK 7) jsou získávány již ve formátu Kramerius - po kontrole a případných opravách metadat jsou data importována do DA. Pro potřeby konverze metadat ve formátu Manuscriptorium (VISK 6) byl vytvořen konverzní program, po nezbytných úpravách metadat a konverzi obrazových souborů na formát DjVu mohou být data importována do DA.
Zpracování dat od vydavatelů
Zpracování dat od vydavatelů velmi závisí na možnostech konkrétního vydavatele poskytnout digitální dokumenty, případně i metadata. Obvykle jsou získány soubory ve formátu PDF, které obsahují jednotlivé články nebo čísla časopisu, ke kterým je třeba metadata vygenerovat z katalogu Medvik a BMČ. Metadata jsou obvykle předávána jako XML soubory v nestandardních formátech.
Ochrana
Zajištění dlouhodbé ochrany digitálních dat je komplexní proces, který zahrnuje nejen technické prostředky ochrany, ale také zajištění organizace, financování, personální zabezpečení a řízení všech procesů probíhajících v systému digitálního archivu. Této oblasti se věnuje řada výzkumných projektů - např. PLANETS, CASPAR a DPE. V rámci těchto projektů vznikají praktické nástroje nejen pro provoz ale zejména pro plánování a řízení systémů pro dlohoudobou ochranu digitálních objektů - např.: PLATTER, DRAMBORA, TRAC.
NLK plánuje v blízké době tyto nástroje vyzkoušet v praxi a kontextu budovaného DA. Prozatím jsme se soustředili na organizaci základních funkcí archivu a technické zabezpečení provozu a bezpečnosti dat DA, které využívá infrastrukturu datového centra NLK vybudovaného v rámci projektu MEDVIK.
Zpřístupnění
Podmínky zpřístupnění digitalizovaných dokumentů jsou dány ochrannými lhůtami definovanými v Autorském zákoně. Volně přístupná mohou být periodika vydaná po roce 1888. V případě monografií po uplynutí 70 let od smrti autora. V opačných případech mohou být díla zpřístupněna pouze v rámci počítačové sítě NLK. V případě vědeckých a odborných dokumentů však není tento model z hlediska využitelnosti vhodný. NLK proto připravila Licenční smlouvu o užití díla pro autory, kteří mají zájem o archivaci a zpřístupnění svých děl s odborným obsahem, která stanovuje mimo jiné podmínky, za kterých lze dílo zpřístupnit v DA. S vydavateli kteří mají zájem o archivaci publikovaných titulů NLK uzavírá Smlouvu o poskytování elektronických online zdrojů. Začínáme také s archivací dokumentů zveřejněných pod licencemi Creative Commons (CC).
CC jsou licence, které umožňují legální využívání a sdílení autorských děl. CC vychází z toho, že existují lidé, kteří nechtějí využívat všechna práva k duševnímu vlastnictví, která jim zaručuje zákon, ale která mohou omezovat sdílení a využívání autorských děl. CC nabízí různá licenční schémata a držitelé autorských práv si mohou vybrat, jaká z autorských práv k dílu si chtějí ponechat a jakých se naopak vzdát ve prospěch veřejnosti. Používání CC v ČR je umožněno díky novele Autorského zákona č. 216/2006 Sb. Česká verze CC byla schválena na jaře 2009.
Obsah achivu
Digitální archiv NLK je přístupný na adrese http://www.medvik.cz/kramerius a jeho obsahem jsou a mohou být následující materiály:
- digitalizovaná tištěná periodika a monografie
- digitalizované staré tisky
- elektronické časopisy
- závěrečné grantové zprávy (IGA MZ ČR)
- konferenční materiály
- digital-born dokumenty
K 16.11. 2009 obsahuje archiv 11 titulů periodik a přes 150 monografických titulů. Nově zpracované dokumenty jsou doplňovány obvykle týdně nebo jednou za 14 dní. Po zpracování plánovaných dokumentů se bude počet dokumentů v DA blížit 300. Aktuální seznam archivovaných dokumentů včetně popisu licencí a podmínek přístupu je uveden zde. Dokumenty byly/budou získány z následujících zdrojů.
Přestože Kramerius standardně podporuje archivaci pouze periodik a monografií, lze ho použít i pro jiné typy strukturou podobných dokumentů. Rozložení obsahu archivu podle fondů NLK je uvedeno v následujícím grafu.
Aktuální obsah archivu podle typu licencí je uveden v následujícím grafu.
Vybrané dokumenty
Digitalizovaná tištěná periodika
Digitalizace tištěných periodik byla v NLK zahájena v roce 2008 díky finanční dotaci z programu MK ČR VISK 7 Kramerius. Pro digitalizaci byla vybrána periodika, tištěná na kyselém papíru. Snahou bylo digitalizovat kompletní vydání (tj. od prvního do posledního vydaného čísla), což se bohužel ne vždy podařilo. NLK též zahájila digitalizaci periodik, které nejsou zničené, ale jsou často využívané. Pro digitalizaci periodik v rámci programu VISK 7 byla vybrána firma Ampaco ČR, ostatní periodika byla/jsou digitalizována přímo v NLK. Seznam tištěných periodik v DA:
|
Dokument, pouze část /
Autor
Rok vydání - Fond -
Licence
|
Zdroj |
Katalog | Archiv |
|---|---|---|---|
|
Boj proti tuberkulose, 1930(11)-1950(31) |
VISK 2008 |
||
|
Věstník Masarykovy ligy proti tuberkulose, 1920(1)-1929(10) |
VISK 2008 |
||
|
Zdraví, 1935(8)-1940(13) |
VISK 2008 |
||
|
Zdraví lidu, 1923(1)-1940(18) |
VISK 2008 |
||
|
Zdravotnická ročenka Československá, 1938(10) |
NLK 2009 |
||
|
Zdravotnické noviny, 1952(1)-1996(45) |
VISK 2009 | ||
|
Zprávy Československého Červeného kříže, 1920(1)-1936(16) |
VISK 2008 |
Elektronické časopisy
V současné době má většina odborných tištěných časopisů i svou elektronickou verzi, některé již vychází pouze elektronicky. Trvalé a dlouhodobé uchování a zpřístupnění těchto elektronických verzí se stává stále důležitějším úkolem. NLK počátkem roku 2009 oslovila české nakladatele odborných biomedicínských časopisů, zda by měli zájem o službu dlouhodobé archivace a zpřístupnění elektronických verzí periodik v digitálním archivu NLK včetně následného propojení s bibliografickou databází Bibliographia medica Čechoslovaca (BMČ). Výsledkem této spolupráce jsou/budou následující archivovaná periodika:
| Dokument, pouze část / Autor Rok vydání - Fond - Licence |
Vydavatel |
Katalog | Archiv |
|---|---|---|---|
|
Adiktologie - ve zpracování |
SCAN |
Medvik |
|
|
Aktuální gynekologie a porodnictví, 2009- |
Aprofema |
||
|
Cardio3, 2001-2005 |
Rekesh Comp. |
||
|
Časopis lékařů českých - ve zpracování |
ČLS JEP |
Medvik |
|
|
Česká kinantropologie, 2007(11, č.3) |
Česká kinantropologická společnost |
||
|
Praktický lékař - ve zpracování |
ČLS JEP |
Medvik |
Staré tisky ze sbírky Zdravotnického muzea
Zdravotnické muzeum je součástí NLK. Spravuje následující sbírky: akologický kabinet, novější nástroje a přístroje, mince a medaile, Würtzova sbírka sošek, další hmotné památky vztahující se k dějinám lékařství, staré tisky, archiv. V DA jsou zatím k dispozici pouze monografie (cca 75 titulů). Mezi nejzajímavější patří:
| Dokument, pouze část / Autor Rok vydání - Fond - Licence |
Katalog | Archiv |
|---|---|---|
|
La commare dell Scipione Mercurio / Mercurio, Girolamo |
||
|
D. Ioannis Sculteti ... Wund-artzneyisches Zeug-Hauss |
||
|
Gruntownij a dokonaly Regiment / Kopp z Raumenthalu, Jan |
||
|
Instrumentarium chirurgicum Viennense / Brambilla, Giovanni
Alessandro |
||
|
Knižka o zachowanj dobrého zdrawj, |
||
|
Orthopedické pomůcky / vypravilo Orthopedické družstvo
Praha-Bubeneč, 1918-1928 |
||
|
Uměnj porodnické, / Jungmann, Antonín Jan |
||
|
Uwod k babenj / Jungmann, Antonín Jan |
Závěrečné grantové zprávy IGA MZ ČR
NLK archivuje závěrečné zprávy Interní grantové agentury Ministerstva zdravotnictví ČR. Zprávy je možné využívat pouze absenčně v prostorách NLK. Pro velký zájem uživatelů začaly být zprávy v roce 2008 digitalizovány. Plné texty digitalizovaných závěrečných zpráv jsou standardně přístupné v souladu s Autorským zákonem pouze z počítačové sítě NLK. V případě souhlasu hlavních řešitelů (podepsáním Licenční smlouvy o užití díla) jsou díla volně přístupná přes Internet. Publikační činnost, která je přílohou závěrečné zprávy, je přístupná pouze z počítačové sítě NLK a je prolinkována do databáze BMČ (Bibliographia medica Čechoslovaca). Digitalizace zpráv probíhá postupně, přednostně jsou digitalizovány práce, u nichž je podepsána licenční smlouva. Výběr zdigitalizovaných prací:
| Dokument, pouze část / Autor Rok vydání - Fond - Licence |
Katalog | Archiv |
|---|---|---|
|
Diagnostika akutní rejekce u pacientů po ortotopické transplantaci
srdce pomocí detekce dárcovské DNA v seru příjemce / Málek, Ivan |
||
|
Informační charakteristiky vývoje lékařské vědy a výzkumu
(identifikace parametrů, tvorba databáze, vytvoření nástroje
srovnávání) / Votípková, Marie |
||
|
Klinický přínos stanovení enzymů purinového metabolizmu a metabolitů
6-merkaptopurinu při terapii azathioprinem u nemocných s ulcerózní
kolitidou a Crohnovou chorobou / Lukáš, Milan |
||
|
Malabsorpce žlučových kyselin u pacientů s Crohnovou chorobou jako
predisponující faktor pro vznik pigmentové cholelithiázy / Lukáš,
Milan |
||
|
Myokarditida a časná stadia dilatační kardiomyopatie: vzájemná
souvislost, diagnostika, přirozený průběh a léčba / Málek, Ivan |
||
|
Olovo a některá rizika reprodukce / Pfeifer, Ivan |
||
|
Podíl onemocnění jícnu v etiologii nekardiální bolesti na hrudníku /
Lukáš, Milan |
||
|
Renální postižení u pacientů s idiopatickými střevními záněty,
nefrotoxicita mesalazinu / řešitel grantu Milan Lukáš |
||
|
Spiroergometrie u nemocných se srdečním selháním / Málek, Ivan |
||
|
Úloha intrarenálního endotelinového systému v rozvoji hypertenzního
orgánového postižení / Vaněčková, Ivana |
||
|
Zhodnocení vývoje, současného stavu a podmínek k zajištění zdravého
tělesného, duševního a sociálního vývoje nové generace do roku 2010 /
Pfeifer, Ivan |
Konferenční materiály
Sborníky, prezentace, postery z konferencí, kongresů, workshopů apod. se řadí mezi tzv. šedou literaturu, kterou nelze získat v běžné distribuční síti. V posledních letech řada z nich vychází pouze v elektronické podobě.
Identifikace pohybových talentů: sborník z mezinárodní konference
Digital-born monografie
Stejně jako u periodik vycházejí některá monografická díla i elektronicky nebo jsou pouze v elektronické podobě. Pro zařazení online monografie do DA je nutné podepsat licenční smlouvu s NLK, případně musí být elektronická verze označená zveřejněna pod licencní CC. Tímto způsobem jsou/budou zpřístupněny publikace:
| Dokument, pouze část / Autor Rok vydání - Fond - Licence |
Katalog | Archiv |
|---|---|---|
|
Drogy a drogové závislosti / Kalina, Kamil |
||
|
Drogy a drogové závislosti: propojování výzkumu, politiky a praxe /
Hartnoll, Richard |
||
|
Interakce mezi léky při substituční léčbě opioidy |
||
|
Léčba problémů spojených se zneužíváním drog / Gossop, Michael |
||
|
Násilí na dětech - syndrom CAN / Hanušová, Jaroslava |
||
|
Prevence užívání drog mezi mladými lidmi / McGrath, Yuko |
||
|
Sexuální zneužívání / Hanušová, Jaroslava |
||
|
Současné možnosti léčby drogové závislosti z pohledu romských
uživatelů drog / Sklenář, Ondřej |
||
|
Srovnání užívání drog a jeho dopadů v krajích České republiky v roce
2002 / Lejčková, Pavla |
||
|
Účinnost programů výměny sterilních jehel a stříkaček |
||
|
Vězeňství a nelegální drogy / (eds.) Michal Mirovský, Harald
Spiring, Miloslava Havlíčková |
||
|
Výměna jehel ve věznicích / Lines, Rick |
Závěr
Další rozvoj DA NLK by měl směřovat k implementaci referenčního modelu OAIS (Open Archival Information System - standard ISO 14721). Stávající systém DA standardu OAIS vyhovuje pouze v dílčích aspektech. Sledujeme však vývoj nové verze Krameria, která by měla požadavky OAIS splňovat.
Klíčové pro další rozvoj digitálního archivu NLK je směřovat postupně k dosažení i dalších stanovených atributů důvěryhodného digitálního repozitáře, který by umožnil následnou certifikaci. Datová kapacita stávajícího úložiště je omezená a se stoupajícím počtem dokumentů ji bude potřeba rozšiřovat. Budování digitální knihovny NLK přináší nové technologické postupy. Zvětšuje se objem digitalizačních prací, např. závěrečných grantových zpráv IGA MZ ČR a dokumentů ohrožených degradací kyselého papíru, u kterých již hrozí jejich nenávratná ztráta.
Důležitým aspektem je také persistentní identifikace objektů v DA pomocí systému identifikátorů (PID), předpokládáme v budoucnu zapojení do národního systému URN, který je řešen pracovní skupinou PID v souvislosti s projektem NK ČR Národní digitální knihovna. Podle posledních informací by měly být první identifikátory založené na číslech České národní bibliografie generovány již v letošním roce. Důležité pro využití v oblasti lékařských informací však je, zda PID navrhne takové schéma, které bude rozšiřitelné o další systémy identifikátorů, v našem případě číslo BMČ.
Aktuálně se však můžeme soustředit na rozvoj spolupráce s vydavateli a autory odborných lékařských publikací, kteří mají zájem o archivaci a zpřístupnění svých publikací a děl v DA NLK. Plánujeme návrh společného standardu pro předávání metadat časopisů, aby bylo možno zefektivnit zpracování dat od vydavatelů. Další důležitou oblastí je průzkum spolupráce se zdravotnickými knihovnami ČR. Digitální knihovna NLK přináší novou hodnotnou službu zdravotnickým uživatelům.



